По словам внука Якова Джугашвили и правнука Иосифа Виссарионовича Сталина Селима Бенсаада, в мае 1941 года, за месяц до начала Великой Отечественной войны, Яков был назначен командиром артиллерийской батареи. Сталин пальцем не пошевелил, чтобы пристроить своего старшего сына в штаб на тепленькое место. Сухо напутствовал Якову: «Иди, воюй!». На фронте он находился с 24 июня 1941 года. И 7 июля отличился в бою под белорусским городом Сенно. Но спустя несколько дней части 20-й армии попали в окружение. 16 июля 1941 года при попытке выхода Яков пропал без вести. Скоро нацистская Германия сообщила, что сын Сталина у них в плену. Будто бы он сдался добровольно, чтобы спасти себя. В действительности он сдался не добровольно, а был вынужден. Своей фамилии не назвал, но это сделали его сослуживцы.
В концлагере Заксенхаузен Яков вел себя замкнуто, ни с кем не разговаривал, никаких просьб не заявлял. На вопрос об исходе войны он решительно говорил, что ни секунды не сомневается в том, что Красная армия победит. В плену не шел на сделку с немцами. И 82 года назад, во второй половине 1943 года Яков был убит часовым при следующих обстоятельствах: Яков перешел через нейтральную тропу к проволоке. Часовой окрикнул: «Стой, стрелять буду!». Яков выругался, разорвал гимнастерку и крикнул: «Стреляй!». Раздался выстрел. Стрелял именно Юнглинг по приказу коменданта Кайндля. Так решили избавиться от свидетеля, понимая, что исход войны неясен, а сын Сталина мог дать показания против них.
Иосиф Виссарионович не был уверен, что Яков в плену (мог быть двойник). По закону военного времени вождь не мог позволить себя шантажировать. Оба сына Сталина – Яков и Василий служили в рядах Красной армии на общих правах с обычными советскими людьми. Почему он (Иосиф Сталин) должен спасти своего сына, а чьего-то оставить там?
По указанию Гитлера изготовили листовки: «Красная армия уже разбита. Сталин уехал в Америку, а его сын у нас в плену». Дочь вождя Светлана Аллилуева вспоминала, как Сталин ей сказал, что торговаться с фашистами из-за Якова не станет.
Маршал Советского Союза Жуков писал, что во время прогулки он поинтересовался у Сталина о его старшем сыне. Тот как-то сразу сгорбился и задумчиво сказал: «Не вырваться Якову из плена. Расстреляют его фашисты». Помолчав, добавил: «Нет, Яков предпочтет любую смерть измене Родине».
академик Национальной академии наук КР